GC色譜柱的維護雖然簡單，但由于許多不同的系統和樣品因素，柱維護的頻度和類型卻是不同的。柱維護的主要目標是如何獲得毛細管色譜柱的優性能和長壽命，而不是簡單地遵循預定的維護時間表中的維護項目。這取決于選擇合適的色譜柱、正確地安裝/系統設置，避免導致柱性能下降（斷裂、熱損壞、氧化損壞、化學損壞以及污染）的主要因素。

GC色譜柱的維護和保養色譜柱的選擇
選擇能提供佳壽命的色譜柱
　　●盡可能使用低流失柱
選擇能對大多數難以分離的樣品提供佳分離度的低性色譜柱
當需要進行異構體的分離時，使用性較大的固定相（當必要時才選擇性較大的固定相，但要盡量使用能滿足分離要求的性小的色譜柱）
采用既能夠完成所要求的分離又能優化溫度范圍的合適的柱尺寸。
 

GC色譜柱的維護和保養柱安裝與設置
得到優化柱性能和壽命的*步是進行正確的安裝。
選擇適合于色譜柱、進樣口和檢測器類型的柱尺寸和密封墊材料。
避免重復使用密封墊。
采用合適的柱切割工具。比如：陶瓷片或金剛石切割器。
將色譜柱安裝在進樣口和檢測器之前，確保柱端口清潔平整。
根據GC*的指標，色譜柱安裝于進樣口和檢測器時插入適當的距離。
柱子必須置于柱架上，毛細管柱的任何部分都不能接觸柱箱壁。
柱箱加熱之前，確保所有接頭都不泄漏，載氣中不含氧氣。