氣相色譜儀的器是密儀器，應該小心使用。用前及用后都要仔細清洗器。清洗針管的小孔，玻璃針筒，地裝配針桿都不是容易的事情，但對延長器的使用壽命是必要的，而且，如果器在使用后便立即清洗，將會更有效、更容易，當針管堵塞或是針筒污染時，器決不能再用。另一個值得推薦的氣相色譜儀器進樣清洗方法是：

    1)、在室溫下用針塞將洗液抽入到器

    2)、用蒸餾水潤洗

    3)、用無油壓縮空氣吹干器

    4)、用無棉纖維仔細的擦針塞，對頑固的污染物，拆卸器，把部件浸泡在清洗溶液中，小的超聲波清洗浴可以加速清洗過程。

    鄭州澤銘氣相色譜儀*提示，決不要快速冷卻或加熱器，加熱決不要超過50℃，因為不同膨脹系數的金屬針管，針塞和玻璃筒可能導致針筒破碎。